Der Flugplatz wurde von 1904 bis 1918 als Flugfeld Gersthofen als Unterabteilung der Fliegerschule Schleißheim von der Königreich Bayern - Bayerische Fliegertruppe genutzt. Im ersten Weltkrieg war in Gersthofen die Fliegerschule V der königlich-bayerischen Fliegertruppen. Dort leistete unter anderem der bekannte Maler Paul Klee seinen Militärdienst ab.

Für den einfachen und schnellen Bau von Flugzeugwerften entwickelten die bayerischen Fliegertruppen einen Musterentwurf, der eine Eisen-Skelettbauweise vorsah. Nach dieser Vorgabe entstand am Flugplatz Gersthofen 1917 eine Werft, die 1980 zusammen mit der gesamten Kasernenanlage aus Gründen der militärischen Sicherheit abgerissen wurde. Ab der Weimarer Republik bezeichnete man den Flugplatz als Flugplatz Gersthofen-Gablingen.